ঢাকায় আসা শিক্ষার্থীদের অভিভাবকগণের একটি বড় দুশ্চিন্তার নাম নিরাপত্তা ব্যবস্থা। ইউনিক বয়েজ হোস্টেল তাই নিরাপত্তা বিষয়টি অত্যন্ত গুরুত্বসহকারে দেখা হয়। মূলফটক Door Control Access System দ্বারা পরিচালিত। অর্থাৎ কেউ চাইলেই হোস্টেলে প্রবেশ করা যাবে না কারণ হোস্টেলের প্রধান ফটকে ফিঙ্গারটেক মেশিন বসানো রয়েছে। একমাত্র কম্পিউটার সফটওয়্যারে যাদের প্রবেশের অনুমতি রয়েছে তারাই শুধু ফিঙ্গার পাঞ্চ করে হোস্টেলে প্রবেশ বা প্রস্থান করতে পারবে। কোন অপরিচিত ব্যক্তি বা আগন্তুকের পক্ষে কোন ক্রমে হোস্টেলে প্রবেশ বা প্রস্থান করা সম্ভব নয়। কারণ যেহেতু হোস্টেলের প্রধান ফটোক নিয়ন্ত্রণ করে কম্পিউটার সফটওয়্যার। ইউনিক বয়েজ হোস্টেল নিরাপত্তার ব্যাপারে আপোষহীন ফিঙ্গারপ্রিন্ট রিডার মেশিন বসানোর মাধ্যমে মূলফটক দিয়ে অনাকাঙ্খিত ব্যক্তির প্রবেশ রোধ করতে সম্পূর্ণরূপে সক্ষম। হোস্টেলের সম্পূর্ণ অংশ সিসি ক্যামেরার নজরদারীর অন্তর্গত যার ফলে কারোর অনধিকার প্রবেশ বা অপরাধ ঘটানোর কোন সুযোগ নেই। এছাড়াও হোস্টেলের বহিরাগতদের প্রবেশ সম্পূর্ণরূপে নিষিদ্ধ যা থেকে প্রমাণিত হয় কর্তৃপক্ষ নিরাপত্তার ব্যাপারে অত্যন্ত কঠোর।